如何通過檢測(cè)值核對(duì)相關(guān)不良事件的等級(jí)
發(fā)布日期:2024-10-28 閱讀量:次
引言:針對(duì)檢驗(yàn)值相關(guān)的不良事件,腫瘤相關(guān)的臨床試驗(yàn)中很多用的是CTCAE的分級(jí)來判斷相關(guān)不良事件的等級(jí),那在實(shí)際工作中,針對(duì)EDC里面錄入的檢驗(yàn)值相關(guān)不良事件的等級(jí),常規(guī)的辦法是是在監(jiān)查過程中一個(gè)個(gè)去查相應(yīng)的檢驗(yàn)值的CTCAE的分級(jí),從而一個(gè)個(gè)地去判斷研究者判斷的等級(jí)是否正確,不正確再去找研究者進(jìn)行修改,由于在實(shí)際工作中, 僅僅是不良事件這一項(xiàng)需要核對(duì)的內(nèi)容就非常多,如名稱,開始日期,結(jié)束日期,與研究藥物的關(guān)系等,而且都還需要跟檢驗(yàn)單進(jìn)行相應(yīng)的核對(duì),在一一核對(duì)的過程中難免會(huì)不那么全面,且每個(gè)不良事件的等級(jí)都要去查詢CTCAE,費(fèi)時(shí)費(fèi)力且效率并不高。那么針對(duì)檢驗(yàn)相關(guān)不良事件,有沒有系統(tǒng)地的方法來判斷檢驗(yàn)相關(guān)不良事件的等級(jí)是否判斷得對(duì),如何根據(jù)檢驗(yàn)相關(guān)的值來對(duì)應(yīng)判斷CTCAE相關(guān)的值呢,我們來嘗試一下。
CTCAE檢驗(yàn)值相關(guān)等級(jí)判斷
在做這個(gè)工作之前,我們需要系統(tǒng)地梳理下CTCAE里的不良事件中,哪些值是與檢驗(yàn)檢查值相關(guān),我們通過查看CTCAE 可以梳理出來哪些檢驗(yàn)檢查值可以直接與等級(jí)相關(guān),可以通過編寫公式,邏輯判斷來考慮進(jìn)行核對(duì)。
總體來說,可以根據(jù)CTCAE 5.0的規(guī)則將相關(guān)檢驗(yàn)值判斷等級(jí)的類型分為3類:
1、只根據(jù)檢驗(yàn)檢測(cè)值判斷不良事件的等級(jí)
2、結(jié)合檢驗(yàn)檢測(cè)值與臨床來判斷等級(jí)
3、只根據(jù)臨床來判斷等級(jí)
這里提到的“臨床”,指的是臨床癥狀或者需要治療的程度來判斷,有些指標(biāo)是需要結(jié)合檢測(cè)值加上癥狀,或只要出現(xiàn)相關(guān)癥狀,都可以做判斷,有些等級(jí)判斷則需要根據(jù)是否需要治療來進(jìn)行判斷相應(yīng)的等級(jí)。
只根據(jù)臨床或臨床結(jié)合檢驗(yàn)值來判斷這兩類比較難于在拉來的檢測(cè)值中迅速地利用公式去判斷,畢竟即使你根據(jù)檢驗(yàn)值進(jìn)行了相頭公式的判斷,但相關(guān)的癥狀或需要治療的意見是寫在病歷里的,無法單純通過檢驗(yàn)值這一個(gè)數(shù)據(jù)來進(jìn)行不良事件等級(jí)的劃分。
所以利用公式根據(jù)純檢驗(yàn)值來判斷不良事件等級(jí)的工作只適用于那些只需要根據(jù)檢驗(yàn)檢測(cè)值判斷不良事件等級(jí)的AE上。
通過對(duì)CTCAE 5.0的梳理,我們梳理出共56條跟檢驗(yàn)檢測(cè)值相關(guān)的,其中只跟檢測(cè)值相關(guān)來判斷等級(jí)的為21條,占比37%,需要結(jié)合臨床來判斷為30條,占比54%, 只根據(jù)臨床來判斷的為5條。
從類別上來看,僅根據(jù)檢測(cè)數(shù)據(jù)查看主要有血常規(guī)與肝功能,還包括一些常見的比如說血脂等指標(biāo)。
那么,對(duì)于常見的依據(jù)只依據(jù)數(shù)據(jù)就能判斷等級(jí)的檢驗(yàn)檢查值,我們?nèi)绾螌?duì)其相應(yīng)的AE的等級(jí)進(jìn)行復(fù)核呢?
檢驗(yàn)值相關(guān)AE等級(jí)的復(fù)核
在這個(gè)分類里,由于相對(duì)照的標(biāo)準(zhǔn)不一樣,也會(huì)分為兩類,一類如血常規(guī),比如說血小板計(jì)數(shù)降低,它的標(biāo)準(zhǔn)就是由正常值范圍開始,正常值范圍到75 * 10 9/L 為1級(jí),75-50 * 10 9/L為2級(jí),50-25 * 10 9/L為3級(jí),小于25 * 10 9/L為4級(jí)。這類標(biāo)準(zhǔn)就非常清晰,只需要明確好正常值范圍的下降是多少,就可以使用IFS函數(shù)來做相應(yīng)的判斷。
另一類則以肝功能為主要代表,它的判斷標(biāo)準(zhǔn)不僅跟正常值有關(guān),也跟基線有關(guān),我們以丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶為例。
即它需要在基線就判斷它的是否在正常值范圍之內(nèi),正常的話是一套判斷標(biāo)準(zhǔn),不正常的話又是一套判斷標(biāo)準(zhǔn),故這類問題,我們需再額外增加一個(gè)IF或IFS函數(shù)來做前期基線的判斷,增加的問題在于需要公式去找到這個(gè)受試者的基線。
那我們以ALT升高這個(gè)不良事件為例,來看看如何核查這個(gè)不良事件的等級(jí)。
第一步:
首先從EDC里拉出生化列表,AE列表,通過在每個(gè)檢驗(yàn)值后面?zhèn)渥⒗飳懙膬?nèi)容,比如AE#5, 與相應(yīng)的受試者編號(hào)進(jìn)行組合,從AE列表中用vlookup 函數(shù)抽取相應(yīng)的不良事件的內(nèi)容,從而把檢驗(yàn)值,訪視與不良事件相關(guān)的內(nèi)容放在同一個(gè)表里,可以檢查出是否有不良事件漏記或不良事件記錄錯(cuò)誤等內(nèi)容。詳細(xì)的步驟可以參見我之前的文章。
第二步:
因?yàn)樯砝飼?huì)有很多項(xiàng),比如說堿性磷酸酶,白蛋白,AST等,由于我們主要要分析ALT(丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶),我們需要能過篩選把所有丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶復(fù)制到一個(gè)新的表中,這樣在后續(xù)寫公式時(shí),行號(hào)與行號(hào)之間連續(xù)的,方便直接下拉公式而不太可能出現(xiàn)錯(cuò)誤。其實(shí)能過篩選在整的生化表里也是能通過下拉復(fù)制公式的,但由于有其他類型的值也在這一個(gè)表里,可能出現(xiàn)問題,出現(xiàn)問題后再去排查會(huì)比較復(fù)雜,為了簡(jiǎn)便,建議復(fù)制同一類型到一個(gè)新的表中。
第三步:
復(fù)制到新的表后,我們首先要解決的是判斷相應(yīng)的ALT的基線是否正常的問題,考慮到基線主要是跟篩選期相關(guān),所以主要考慮篩選期檢測(cè)值是否比參考值的上限大,那針對(duì)篩選期就可以寫出如下公式:
=IF(AND(G2<=J2,B2="篩選期(-28~-1天)"),"基線正常","基線升高")
判斷訪視是否為篩選期,如果篩選期的話,檢測(cè)值小于等于正常值上限,那就顯示“基線正常”,如果不是,即大于正常值上限,則顯示“基線升高”。相應(yīng)的基線正常與基線升高另起一列存儲(chǔ)。
現(xiàn)在會(huì)出現(xiàn)一個(gè)問題,即同個(gè)病人下次訪視,我們也希望它對(duì)應(yīng)的那一行,也能顯示”基線正?!?,畢竟”基線正常“在篩選期已經(jīng)評(píng)判過了。但是下一次訪視的名稱肯定不是篩選期了,那如何處理呢?
我們來判斷下一次訪視如果還是同個(gè)病人的話,我們判斷基線是可以沿用前面的判斷的,但是如果下一行是另一個(gè)病人的話,則需要查看是否為篩選期,如果是篩選期,又得重啟檢測(cè)值與正常值上限的判斷,從而顯示是否是“基線正?!斑€是”基線升高“。
基于此思路,我們?cè)诤Y選期的下面一行的T列T3寫下如下公式:
=IF(A3=A2,T2,IF(B3="篩選期(-28~-1天)",IF(G3<=J3,"基線正常","基線異常"),"0"))
即如果發(fā)現(xiàn)病人號(hào)是相等的,直接引用T2行的判斷,如果不相等,則意味著是新的病人號(hào),這時(shí)檢查是否為篩選期,如果是進(jìn)行相應(yīng)的基線正常與基線異常的判斷,如果不是,則用0表示,以提醒自己注意特殊情況。
什么樣的特殊情況呢,一般而言,如果按病人號(hào)進(jìn)行排序,再按樣本采集日期排序,一般就不會(huì)出現(xiàn)后面的隨訪在篩選期前面,如果之前沒有排好序,就有可能出現(xiàn)一個(gè)病人C1D4排出一個(gè)病人的篩選期之前,這時(shí)就需要進(jìn)行順序的調(diào)整的。所以在寫這個(gè)公式之前,可以按病人號(hào)與樣本采集日期做好相應(yīng)的排列。
寫完上面的公式后,就可以直接下拉把下面相應(yīng)的狀態(tài)填滿了,整體測(cè)試了一下,沒有發(fā)現(xiàn)什么問題,即篩選期判斷的狀態(tài)在這個(gè)病人后面的隨訪的行都沿用下來了。
第四步:
現(xiàn)在我們已經(jīng)有了每個(gè)值每行的基線的狀態(tài)了(基線正常還是基線升高),這時(shí)我們就可以根據(jù)CTCAE的規(guī)則來增加一列書寫公式,讓公式根據(jù)CTCAE的規(guī)則,來自動(dòng)判斷相應(yīng)的ALT的值升高的等級(jí)了。
我們?cè)黾右涣小辈涣际录燃?jí)的核對(duì)“,這一行把它設(shè)在原來引用來出來不良事件里“不良事件等級(jí)”字段的旁邊,方便后續(xù)進(jìn)行比較。
這里需要考慮到的是按基線正常與基線異常分為兩大類,每一大類下面根據(jù)值的大小,分為正常,不良事件1級(jí),2級(jí),3級(jí),4級(jí)共5個(gè)等級(jí)。正常的考慮到原來引用的不良事件“不良事件等級(jí)”字段在表格中是空的,那正常的值的判斷的結(jié)果我們就用空值來表示,那其他等級(jí),比如說1級(jí),那就1來表示,2級(jí)就用2來表示,以此類推。因?yàn)椴涣际录铩辈涣际录燃?jí)“的字段也是用此方式來表示的,保持一致方便屆時(shí)進(jìn)行比對(duì)。
我們?cè)诓涣际录燃?jí)核對(duì)的那一行U36寫的公式如下:
=IFS(T36="基線正常",IFS(G36
考慮到比較復(fù)雜,使用了IFS這個(gè)函數(shù),方便思路清晰,同時(shí)為了方便后續(xù)跟不良事件里”不良事件等級(jí)“字段進(jìn)行比較,直接使用了數(shù)字1,2,3,4來表示等級(jí),沒有加雙引號(hào),因?yàn)榧由想p引號(hào)EXCEL會(huì)認(rèn)為是文本,后續(xù)比較反而會(huì)不方便。
寫完后直接往下來就可以根據(jù)CTCAE5.0的規(guī)劃,自動(dòng)把所有的不良事件應(yīng)該的等級(jí)根據(jù)ALT的值判斷好了。如果是正常的,那一行顯示的是空折,如果不正常,則顯示自應(yīng)的等級(jí)。
第五步:
這個(gè)時(shí)候,我們可以看到自動(dòng)判斷的等級(jí)顯示在U列,EDC上不良事件填寫的等級(jí)放在V列,我們需要做的是來比較2列相應(yīng)的數(shù)字是否相等。
這時(shí)我們可以使用條件格式來對(duì)于不良事件等級(jí)那列(即V列)做一個(gè)條件格式,即我們?cè)O(shè)立公式,=U1<>V1,則把底色顯示為紅色。
設(shè)置完成后,所有在V列與U列判斷不相等的值均用紅色底色標(biāo)出來,我們可以能過篩選顏色把這部分異常數(shù)據(jù)快速地找出來。
發(fā)現(xiàn)了有不良事件的疑似漏記,及相應(yīng)的不良事件等級(jí)判斷不一致的情況,這時(shí)我們可以人工挑出幾個(gè)進(jìn)行核對(duì)一下,看是否符合規(guī)則,比如說第一個(gè),正常值上限是60,值 是70,基線正常,那3倍以下是1級(jí),60的三倍是180,那檢測(cè)值79小于180,按道理是評(píng)價(jià)為1級(jí),我們公式判斷正確,而不良事件表中不良事件的等級(jí)記錄錯(cuò)誤。同樣選一個(gè)值為316,這時(shí)大于正常值上限60的5倍(300),在基線正常的情況下,大于5倍按規(guī)則應(yīng)該是3級(jí),公式判斷正確,而研究中心在EDC上記錄為2級(jí),這時(shí)就可以提醒研究中心,看看是老師判斷錯(cuò)誤還是CRC填寫錯(cuò)誤,能及時(shí)發(fā)現(xiàn)相應(yīng)的錯(cuò)誤情況。
這里只是舉了一個(gè)ALT的例子,CTCAE 5.0里純靠數(shù)字能判斷的指標(biāo)清單如下:大家可以依同樣的方式去做相應(yīng)的公式來做好此類自動(dòng)判斷。當(dāng)然一些數(shù)值加臨床判斷的部分等級(jí)也可以使用公式來進(jìn)行初步判斷。
不良事件名稱 | 檢驗(yàn)類別 | 升高或降低 |
高膽固醇血癥 | 血脂 | 升高 |
血紅蛋白增高 | 血常規(guī) | 升高 |
淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)降低 | 血常規(guī) | 降低 |
淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)增高 | 血常規(guī) | 升高 |
中性粒細(xì)胞計(jì)數(shù)降低 | 血常規(guī) | 降低 |
血小板計(jì)數(shù)降低 | 血常規(guī) | 降低 |
白細(xì)胞數(shù)降低 | 血常規(guī) | 降低 |
射血分?jǐn)?shù)降低 | 心臟超聲 | 降低 |
肌酸磷酸激酶增高 | 心肌損傷 | 升高 |
肌酐增高 | 腎功能 | 升高 |
纖維蛋白原降低 | 凝血功能 | 降低 |
蛋白尿 | 尿常規(guī) | 升高 |
CD4 陽(yáng)性淋巴細(xì)胞降低 | 淋巴細(xì)胞亞群 | 降低 |
丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶增高 | 肝功能 | 升高 |
堿性磷酸酶增高 | 肝功能 | 升高 |
天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶增高 | 肝功能 | 升高 |
血膽紅素增高 | 肝功能 | 升高 |
血乳酸脫氫酶升高 | 肝功能 | 升高 |
γ 谷氨酰胺轉(zhuǎn)移酶增高 | 肝功能 | 升高 |
觸珠蛋白降低 | 肝功能 | 降低 |
用力呼氣量降低 | 肺功能測(cè)試 | 降低 |
結(jié)語
這里只是舉了一個(gè)例子,如果要把全面的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)值做好相關(guān)的公式,并做出來的話,工作量還是會(huì)很大,但是如果能依據(jù)自己所用的EDC系統(tǒng)做出一套這樣的自動(dòng)判斷的內(nèi)容,則遠(yuǎn)程及時(shí)發(fā)現(xiàn)相應(yīng)的不良事件相關(guān)的邏輯錯(cuò)誤就成為可能,
希望能對(duì)你有幫助!
作者:博哥碎碎念
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