乙型肝炎病毒基因分型檢測試劑技術(shù)審查指導原則(2015年第32號)
發(fā)布日期:2015-07-15 閱讀量:次
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乙型肝炎病毒基因分型檢測試劑技術(shù)審查指導原則
本指導原則旨在指導注冊申請人對乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)基因分型檢測試劑注冊申報資料的準備及撰寫,同時也為技術(shù)審評部門審評注冊申報資料提供參考。
本指導原則是對乙型肝炎病毒基因分型定性檢測試劑的一般要求,申請人應(yīng)依據(jù)產(chǎn)品的具體特性確定其中內(nèi)容是否適用,若不適用,需具體闡述理由及相應(yīng)的科學依據(jù),并依據(jù)產(chǎn)品的具體特性對注冊申報資料的內(nèi)容進行充實和細化。
本指導原則是供申請人和審查人員使用的指導性文件,不涉及注冊審批等行政事項,相關(guān)人員應(yīng)在遵循相關(guān)法規(guī)的前提下使用本指導原則。
本指導原則是在現(xiàn)行法規(guī)、標準體系及當前認知水平下制定的,隨著法規(guī)、標準的不斷完善和科學技術(shù)的不斷發(fā)展,本指導原則相關(guān)內(nèi)容也將適時進行調(diào)整。
一、范圍
我國2006年乙型肝炎流行病學調(diào)查表明,我國1—59歲一般人群乙型肝炎表面抗原(Hepatitis B surface antigen,HBsAg)攜帶率為7.18%,5歲以下兒童的HBsAg僅為0.96%。據(jù)此推算,我國現(xiàn)有的慢性HBV感染者約9300萬人,其中慢性乙型肝炎患者約2000萬例;由于不同的乙型肝炎病毒基因型對現(xiàn)有藥物治療可能存在不同的治療響應(yīng),乙型肝炎病毒分型基因檢測在慢性乙型肝炎患者治療中的作用正被越來越多人所關(guān)注。
根據(jù)HBV全基因序列異質(zhì)性≥8%的界線,可將其分為不同的基因型。目前,已鑒定的HBV基因型有A—I九種,基因型與血清亞型之間的關(guān)系已被清晰論證?;蛐蛄械膯蝹€核酸的變化即可能改變血清亞型,但血清亞型不能反映基因的差異。通過對HBV全序列分析發(fā)現(xiàn),在不同基因型之間S區(qū)段異質(zhì)性最大,而型內(nèi)S區(qū)段的異質(zhì)性最小,從而也可以根據(jù)S區(qū)基因序列異質(zhì)性≥4%的標準區(qū)分不同的基因型。在此基礎(chǔ)上,發(fā)展了一系列簡單、準確的分型方法,推動了HBV基因型的流行病學及臨床相關(guān)研究。
基于現(xiàn)階段研究,在我國HBV以C型和B型為主。HBV基因型與疾病進展和干擾素α治療效果有關(guān)。與C基因型感染者相比,B基因型感染者較早出現(xiàn)乙型肝炎e抗原(hepatitis B e antigen,HBeAg)血清學轉(zhuǎn)換,較少進展為慢性肝炎、肝硬化和原發(fā)性肝細胞癌;并且HBeAg陽性患者對干擾素α治療的應(yīng)答率高于C基因型;A基因型患者應(yīng)答率高于D基因型。其他基因型與疾病譜的關(guān)系還未有特殊發(fā)現(xiàn)。但是,由于基因型分布不均衡和樣本大小的影響,還需要作多中心大樣本的研究方能進一步了解基因型與疾病譜之間的關(guān)系。
HBV基因型的分布具有明顯的地理學特點,大體上如下:
A基因型主要流行于美國及北歐國家;B和C基因型主要分布在亞洲及遠東地區(qū);D基因型在世界各地均有發(fā)現(xiàn),但主要分布于地中海地區(qū);E基因型僅限于非洲;F基因型則分布在中美洲;G、H、I及J型基因型的地理分布尚不清楚。隨著時間的推移,新的基因型可能會被陸續(xù)發(fā)現(xiàn)。
HBV基因分型檢測試劑是指利用包括分子生物學相關(guān)方法在內(nèi)的核酸檢測技術(shù),以HBV基因序列為檢測靶標,對人血清、血漿等樣本中的HBV不同基因型進行體外定性檢測的試劑。結(jié)合臨床表現(xiàn)和其他實驗室指標,可作為乙型肝炎感染者臨床診療的輔助指標之一。
本指導原則適用于基于實時熒光(polymerase chain reaction,PCR)方法的HBV基因分型檢測試劑,其他方法學的定性檢測方法可參照本指導原則,但應(yīng)根據(jù)產(chǎn)品特性確定其中具體內(nèi)容是否適用,如不適用,應(yīng)另行選擇符合自身方法學特性的技術(shù)要求或評價方法。本指導原則適用于進行產(chǎn)品注冊和相關(guān)許可事項變更的產(chǎn)品。其他未盡事宜(包括產(chǎn)品風險分析資料等),應(yīng)當符合《體外診斷試劑注冊管理辦法》(國家食品藥品監(jiān)督管理總局令第5號)(以下簡稱《辦法》)等相關(guān)法規(guī)要求。
二、注冊申報資料要求
(一)綜述資料
綜述資料主要包括產(chǎn)品預(yù)期用途、產(chǎn)品描述、有關(guān)生物安全性的說明、研究結(jié)果的總結(jié)評價以及同類產(chǎn)品上市情況介紹等內(nèi)容,其中同類產(chǎn)品上市情況介紹部分應(yīng)著重從方法學及不同基因型檢出能力等方面寫明擬申報產(chǎn)品與目前市場上已獲批準的同類產(chǎn)品之間的主要區(qū)別。若尚無同類產(chǎn)品批準上市,則應(yīng)詳細對該產(chǎn)品的有效性及安全性進行論述,說明理論依據(jù)。
提交的資料應(yīng)符合《辦法》和《關(guān)于公布體外診斷試劑注冊
申報資料要求和批準證明文件格式的公告》(國家食品藥品監(jiān)督管理總局公告2014年第44號)的相關(guān)要求。
(二)主要原材料研究資料
應(yīng)提供主要原材料如引物、探針、企業(yè)參考品的選擇與來源、制備過程、質(zhì)量分析和質(zhì)控標準等相關(guān)研究資料。若主要原材料為企業(yè)自己生產(chǎn),其生產(chǎn)工藝必須相對穩(wěn)定,并提交工藝驗證報告;如主要原材料購自其他供貨商,應(yīng)提供的資料包括:供貨方提供的質(zhì)量標準、出廠檢定報告,以及該原材料到貨后的質(zhì)量檢驗資料。主要包括以下內(nèi)容:
1.核酸分離/純化組分(如有)的主要組成、原理介紹及相關(guān)的驗證資料。
2.PCR和組分的主要原料(包括引物、探針、各種酶及其他主要原料)的選擇、制備、質(zhì)量標準及實驗研究資料,主要包括以下內(nèi)容:
2.1脫氧三磷酸核苷(dNTP)
核苷酸的組成成分,包括:dATP、dUTP、dGTP、dCTP和dTTP,對純度、濃度、保存穩(wěn)定性等的驗證資料。
2.2引物
由一定數(shù)量的堿基構(gòu)成的特定序列,通常采用(Deoxyribonucleic acid,DNA)合成儀人工合成,合成后經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)或其他適宜方法純化。需提供對分子量、純度、穩(wěn)定性、功能性實驗等的驗證資料。如為外購,應(yīng)提供合成機構(gòu)出具的合成產(chǎn)物的質(zhì)檢證明,如PAGE電泳結(jié)果或高效液相色譜法(HPLC)分析圖譜。
2.3探針
特定的帶有示蹤物(標記物)的已知核酸片段(寡聚核苷酸片段),能與互補核酸序列退火雜交,用于特定核酸序列的探測。合成后經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)或其他適宜方法純化,在5’-端(和/或3’-端)進行標記,并經(jīng)HPLC或其他適宜方法純化,純度應(yīng)達到HPLC純。應(yīng)提供合成機構(gòu)出具的合成產(chǎn)物的質(zhì)檢證明,如HPLC分析圖譜,應(yīng)對探針的分子量及標記的熒光素進行核實,并進行功能性試驗驗證。
2.4酶
DNA聚合酶,應(yīng)具有DNA聚合酶活性,無核酸內(nèi)切酶活性,具熱穩(wěn)定性,如:94℃保溫1小時后仍保持50%活性;尿嘧啶糖基化酶(UNG),具有尿嘧啶糖基化活性,無核酸外切酶及核酸內(nèi)切酶活性,應(yīng)對酶活性有合理驗證。如使用其他工具酶,應(yīng)提供其詳細的研究資料。
2.5核酸類檢測試劑的包裝材料和耗材應(yīng)無DNase和RNase污染。
2.6企業(yè)內(nèi)部參考品及試劑內(nèi)對照(質(zhì)控品):
由于乙型肝炎病毒不易培養(yǎng),制備相應(yīng)的參考品及質(zhì)控品時,參考品設(shè)置建議采用滅活病毒的血清/血漿。并且參考品及質(zhì)控品與被測臨床樣本在整個試驗過程中應(yīng)保持相同的檢測方式。
企業(yè)內(nèi)部參考品以及質(zhì)控品設(shè)置必須客觀合理,能夠充分評價產(chǎn)品的質(zhì)量。應(yīng)采用金標準或其他方法對企業(yè)內(nèi)部參考品以及質(zhì)控品中物質(zhì)成分進行確認。
2.6.1陽性參考品及陽性質(zhì)控品
陽性參考品應(yīng)包含試劑盒所能檢測的所有基因型(所有的單基因型以及所有的重組基因型),每個基因型應(yīng)設(shè)置不同濃度水平,應(yīng)能滿足驗證產(chǎn)品性能的需要,至少設(shè)置兩個濃度水平(弱陽性、中或強陽性);常見基因型(如B型、C型)陽性參考品設(shè)置建議采用滅活病毒的血清/血漿。其他基因型陽性參考品設(shè)置可采用模擬臨床樣本。對于陽性參考品的獲取方式建議使用金標準的方法或同類方法或者其他能證明問題的方法進行確認。
陽性質(zhì)控品應(yīng)包含目標靶基因,用于監(jiān)控整個檢測過程,包括:核糖核酸提取,基因擴增和檢測。陽性質(zhì)控品作為單獨檢測過程,用于模擬患者樣本,用于與患者樣本進行同時檢測。
2.6.2陰性參考品及陰性質(zhì)控品
可采用經(jīng)確認無目標靶基因的序列的樣本。陰性參考品及陰性質(zhì)控品對照物可反映非特異擴增或檢測過程,當不存在目標序列時不會得到相關(guān)信號。陰性參考品設(shè)置建議采用滅活的血清/血漿。陰性質(zhì)控品應(yīng)參與樣本核酸的平行提取,對假陽性結(jié)果進行質(zhì)量控制。
2.6.3靈敏度參考品(檢測限參考品)
靈敏度參考品是評價產(chǎn)品檢測能力的重要工具,對于定性產(chǎn)品來說,其設(shè)計的合理性顯得非常重要。在基因型設(shè)置方面,應(yīng)包括試劑盒所包含的所有基因型。在濃度設(shè)置方面,應(yīng)采用核酸定量的方法對該參考品進行定量檢測,明確被測物的具體量值,設(shè)置濃度應(yīng)接近產(chǎn)品最低檢出限。
2.6.4精密度參考品
精密度參考品應(yīng)反映產(chǎn)品檢測的重復(fù)性以及重復(fù)檢測的穩(wěn)
定性,該部分參考品應(yīng)采用臨床樣本作為精密度參考品,需包括陰性、弱陽性、中或強陽性三個濃度水平的精密度驗證。
2.6.5內(nèi)對照(內(nèi)標)
與目標靶基因平行提取,擴增;用于對檢測管內(nèi)抑制物造成的假陰性結(jié)果進行質(zhì)量控制。內(nèi)對照(內(nèi)標)可采用競爭性或非競爭性的引物設(shè)置。
2.6.6其他需要注意問題
如單個產(chǎn)品檢驗原理為兩種方法學或多種方法學聯(lián)合檢測的方法,應(yīng)對產(chǎn)品中每種方法學均設(shè)置參考品及質(zhì)控品,用于對不同方法學的質(zhì)量監(jiān)控,例如:檢測原理為PCR-雜交方法聯(lián)用,在這種情況下,不僅需在PCR環(huán)節(jié)設(shè)置參考品及質(zhì)控品對擴增過程進行質(zhì)量控制;同時在基因探針雜交環(huán)節(jié)也必須設(shè)置質(zhì)控程序?qū)﹄s交過程進行質(zhì)量控制。
(三)主要生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系的研究資料
基本生產(chǎn)工藝主要包括:配制工作液、半成品檢定、分裝和包裝。配制工作液的各種原材料及其配比應(yīng)符合要求,原材料應(yīng)混合均勻,配制過程應(yīng)對pH、電導率等關(guān)鍵參數(shù)進行有效控制。
生產(chǎn)工藝研究的資料應(yīng)能對反應(yīng)體系涉及到的基本內(nèi)容,如樣本類型、樣本用量、試劑用量、反應(yīng)條件、校準方法、質(zhì)控方法、穩(wěn)定性和有效期,提供確切的依據(jù),主要包括以下內(nèi)容:
1.主要生產(chǎn)工藝介紹,可以圖表方式表示。
2.反應(yīng)原理介紹。
3.基因位點選擇、PCR方法學特性介紹。
4.DNA提取純化方法優(yōu)化,建議包含純化步驟,內(nèi)標、質(zhì)控品均應(yīng)全程參與提取純化,不建議采用煮沸法進行DNA提取。
5.確定最佳PCR反應(yīng)體系的研究資料,包括酶濃度、引物/探針濃度、dNTP濃度、陽離子濃度、樣本量、加樣量及反應(yīng)體積等。
6.確定PCR各階段溫度、時間及循環(huán)數(shù)的研究資料。
7.對于基線閾值(threshold)和閾值循環(huán)數(shù)(Ct)確定的研究資料。
8.不同適用機型的反應(yīng)條件的對比分析,如果有差異應(yīng)分別詳述。
如單個產(chǎn)品檢驗原理為兩種方法學或多種方法學聯(lián)合檢測的方法,例如:檢測原理為PCR方法和基因探針雜交方法聯(lián)用。應(yīng)在上述1至8項基礎(chǔ)上完善以下工作:
1.主要生產(chǎn)工藝及反應(yīng)原理介紹。
2.雜交膜條的制備工藝。
3.確定最佳雜交反應(yīng)體系的研究資料,包括酶濃度、探針濃度、樣本量、加樣量及反應(yīng)體積等。
4.確定雜交各階段溫度、時間的研究資料。
5.交叉污染和攜帶污染研究。
該類產(chǎn)品適用于檢測乙型肝炎病毒感染人群,在臨床檢測中發(fā)現(xiàn),部分臨床樣本會出現(xiàn)高濃度的乙型肝炎病毒載量。這部分臨床樣本在提取過程中增加了交叉污染及攜帶污染的可能性。在核酸提取過程中,從而導致假陽性的結(jié)果。
如產(chǎn)品配套采用自動提取設(shè)備提取DNA,在攜帶污染試驗中,建議將高濃度陽性(病毒濃度至少不低于108IU/mL)樣本與陰性樣本在同一待提取反應(yīng)板中連續(xù)交替排列并應(yīng)進行不少于5輪上述提取研究。建議試驗使用的高陽性樣本水平應(yīng)接近該產(chǎn)品檢測能力的上限。以鄰近高陽性樣本的陰性樣本的陰性結(jié)果對比未鄰近高陽性樣本的陰性結(jié)果,評估攜帶和交叉污染的影響。
如產(chǎn)品檢測原理中涉及開管檢測過程,如自動化膜條雜交儀,應(yīng)參照該項要求進行驗證。
(四)分析性能評估資料
企業(yè)應(yīng)提交在產(chǎn)品研制階段對試劑盒進行的所有性能驗證的研究資料,包括具體研究方法、內(nèi)控標準、實驗數(shù)據(jù)、統(tǒng)計分析等詳細資料。如有相應(yīng)的國家參考品,應(yīng)在分析性能評估階段采用國家參考品對產(chǎn)品性能進行驗證。建議著重對以下分析性能進行研究:
1.陽性/陰性參考品符合率
所有基因型別的陽性參考品均應(yīng)按要求檢出陽性,考慮到濃度梯度的不同,應(yīng)對各水平陽性參考品設(shè)置相應(yīng)Ct值的限制;陰性參考品應(yīng)按要求檢出為陰性。
2.最低檢測限(分析靈敏度)
建議采用95%(n≥20)的陽性檢出率作為最低檢測限確定的標準,應(yīng)明確各基因型的最低檢出限。申報試劑應(yīng)在最低檢出限或接近最低檢出限的病毒濃度對說明書描述的所有基因型進行驗證。
3.分析特異性
3.1交叉反應(yīng)
用于HBV DNA分型檢測試劑交叉反應(yīng)驗證的病原體種類主要考慮以下幾方面可能性:
3.1.1核酸序列具有同源性、易引起相同或相似的臨床癥狀的其他病原體。
3.1.2申報產(chǎn)品中不同基因型以及乙型肝炎病毒其他基因型對被檢測基因型的影響。對于難以獲得的基因型, 可采用針對該基因型構(gòu)建的質(zhì)?;蚱渌蚬こ坍a(chǎn)品進行交叉驗證。
3.1.3建議用高濃度的病原體對乙型肝炎病毒核酸陰性樣本進行交叉反應(yīng)的驗證。申請人應(yīng)提供所有用于交叉反應(yīng)驗證的病毒和細菌的來源、種屬/型別和濃度確認等試驗資料。
3.2干擾物質(zhì)
潛在的干擾物質(zhì)主要包括:內(nèi)源性干擾物質(zhì)和外源性干擾物質(zhì)。
3.2.1內(nèi)源性干擾物質(zhì):樣本中常見干擾物質(zhì)對檢測結(jié)果的影響,如血紅蛋白、甘油三酯、膽紅素等。
3.2.2外源性干擾物質(zhì):常用抗凝劑,臨床常用抗病毒藥物如:干擾素、拉米夫定、阿德福韋酯、恩替卡韋、替比夫定等對檢測結(jié)果的影響。
3.2.3建議在病毒的檢測臨界值水平對每種干擾物質(zhì)的干擾影響進行檢測。干擾物濃度的分布應(yīng)覆蓋人體生理及病理狀態(tài)下可能出現(xiàn)的物質(zhì)濃度。應(yīng)注明不同干擾物質(zhì)對被檢測物質(zhì)無干擾的最高限值。對于不易收集的干擾物質(zhì)濃度樣本可使用臨床模擬樣本進行調(diào)節(jié)。
4.精密度
精密度的評價方法并無統(tǒng)一的標準可依,可根據(jù)不同產(chǎn)品特征或企業(yè)的研究習慣進行,前提是必須保證研究的科學合理性。具體實驗方法可以參考相關(guān)的國外或國內(nèi)有關(guān)體外診斷產(chǎn)品性能評估的文件進行。企業(yè)應(yīng)對每項精密度指標的評價標準做出合理要求,如標準差或變異系數(shù)的范圍等。針對本類產(chǎn)品的精密度評價主要包括以下要求:
4.1用于精密度評價的樣本濃度水平應(yīng)至少包含陰性、弱陽性和強陽性三個水平。
4.2合理的精密度評價周期,例如:為期至少20天的連續(xù)檢測,每天至少由2人完成不少于2次的完整檢測,從而對批內(nèi)/批間、日內(nèi)/日間以及不同操作者之間的精密度進行綜合評價。如有條件,申請人應(yīng)選擇不同的實驗室進行重復(fù)實驗以對室間精密度進行評價。
5.基因混合型的研究
該部分研究主要包括兩個目的:一是申報試劑檢測不同濃度混合型的能力。申請人應(yīng)設(shè)置不同濃度比例的混合型進行驗證。二是申報試劑在判讀結(jié)果時,是否能夠有效區(qū)分基因重組型和基因混合型。申請人應(yīng)設(shè)置不同濃度的基因重組型與不同混合比例的基因混合型進行驗證。
因理想的不同濃度比例基因混合型樣本在臨床單位中難以收集,申請人可以使用臨床模擬樣本進行驗證。該部分樣本建議用核酸測序明確樣本中包含的所有基因型序列,同時應(yīng)使用核酸定量的方法確定不同基因型的濃度。
如申報產(chǎn)品的結(jié)果判讀無法有效區(qū)分基因混合型與基因重組型,應(yīng)在產(chǎn)品說明書中進行注明。
6.HBV核酸分離純化
病毒DNA提取主要有以下目的:富集目的基因濃度、保證目的基因序列的完整性、增加PCR模板溶液均一性、去除PCR抑制物,是決定PCR成敗的重要因素之一。企業(yè)應(yīng)對核酸提取的環(huán)節(jié)做詳細的驗證。
(五)陽性判斷值或參考區(qū)間確定資料
陽性判斷值確定資料主要指對核酸檢測的Ct值進行確認,建議申請人對申報產(chǎn)品用于結(jié)果判斷的臨界值予以確認。參考值范圍研究資料樣本來源應(yīng)考慮不同年齡、型別、地域等因素,盡可能考慮樣本來源的多樣性、代表性。如存在參考值灰區(qū),應(yīng)提供灰區(qū)的確認資料。如采用其他方法對陽性判斷值進行確認研究,應(yīng)說明這種方法的合理性。對于此類試劑,正常人群及其他患病人群中一般不應(yīng)檢出HBV基因型。
(六)穩(wěn)定性研究資料
穩(wěn)定性研究資料主要涉及兩部分內(nèi)容,申報試劑的穩(wěn)定性和適用樣本的穩(wěn)定性研究。前者主要包括實時穩(wěn)定性(有效期)、運輸穩(wěn)定性、開瓶穩(wěn)定性及凍融次數(shù)限制等研究,申請人可根據(jù)實際需要選擇合理的穩(wěn)定性研究方案。穩(wěn)定性研究資料應(yīng)包括研究方法的確定依據(jù)、具體的實施方案、詳細的研究數(shù)據(jù)以及結(jié)論。對于實時穩(wěn)定性研究,應(yīng)提供至少3批樣品在實際儲存條件下保存至成品有效期后的研究資料。
應(yīng)對樣本穩(wěn)定性進行研究,主要包括室溫保存、冷藏和冷凍條件下的有效期驗證,可以在合理的溫度范圍內(nèi)選擇溫度點(溫度范圍),每間隔一定的時間段即對儲存樣本進行全性能的分析驗證,從而確認不同類型樣本的效期穩(wěn)定性。適于冷凍保存的樣本還應(yīng)對凍融次數(shù)進行評價。
試劑穩(wěn)定性和樣本穩(wěn)定性兩部分內(nèi)容的研究結(jié)果應(yīng)在說明書【儲存條件及有效期】和【樣本要求】項中進行詳細說明。
(七)臨床試驗
1.試驗方法
乙型肝炎病毒基因分型核酸檢測試劑目前主要供臨床醫(yī)護人員對慢性乙型肝炎患者設(shè)置臨床治療方案提供參考依據(jù)。隨著乙型肝炎基因型與肝炎病情關(guān)系的研究工作不斷深入,研究方法不斷改進,新的研究成果可能將被轉(zhuǎn)化應(yīng)用于臨床工作中。如乙型肝炎病毒基因分型核酸檢測試劑用于新的臨床用途,應(yīng)根據(jù)新的臨床用途特點設(shè)置具有針對性的臨床試驗研究方案。
參比方法的選擇可以考慮以下幾方面:
1.1 如已有同類產(chǎn)品上市,可以選擇境內(nèi)已批準上市、臨床普遍認為質(zhì)量較好的同類產(chǎn)品作為參比試劑,采用擬申報產(chǎn)品(以下稱考核試劑)與之進行對比試驗研究,證明本品與已上市產(chǎn)品等效或優(yōu)于已上市產(chǎn)品。應(yīng)充分考慮已上市同類試劑的型別選擇、靶序列選擇、分析靈敏度等特性,確??己嗽噭┡c申報試劑具有明確可比性。
1.2 申請人亦可采用核酸序列測定方法作為此類試劑臨床試驗研究的參比方法,驗證考核試劑檢測結(jié)果與核酸序列測定(測序)結(jié)果之間的一致性情況。臨床試驗報告中應(yīng)對選用的測序方法做詳細介紹。
申請人應(yīng)提供以下關(guān)于測序部分的詳細試驗資料,需有臨床試驗單位簽章確認:
1.2.1 測序方法原理、測序儀型號、測序試劑及消耗品的相關(guān)信息。
1.2.2 測序方法所用引物相關(guān)信息,如基因區(qū)段選擇,分子量、純度、功能性實驗等資料。引物設(shè)計應(yīng)合理涵蓋考核試劑擴增的靶核酸區(qū)段、位點、及所有突變類型。
1.2.3 對所選測序方法的分析性能進行合理驗證,尤其是最低檢測限的確認,建議將所選測序方法與申報試劑的相關(guān)性能進行適當比對分析。
1.2.4 測序方法應(yīng)建立合理的陽性質(zhì)控品和陰性質(zhì)控品對臨床樣本的檢測結(jié)果進行質(zhì)量控制。
1.2.5 提交有代表性的樣本測序圖譜及結(jié)果分析資料。
2.臨床試驗機構(gòu)的選擇
臨床試驗機構(gòu)應(yīng)獲得國家食品藥品監(jiān)督管理總局資質(zhì)認可。建議申請人在選擇臨床試驗機構(gòu)時,應(yīng)考慮試驗機構(gòu)之間的地域代表性,臨床試驗機構(gòu)應(yīng)具有分子生物學方法檢測的優(yōu)勢,實驗操作人員應(yīng)有足夠的時間熟悉檢測系統(tǒng)的各環(huán)節(jié)(儀器、試劑、質(zhì)控及操作程序等),熟悉評價方案。在整個實驗中,考核試劑和對比試劑都應(yīng)處于有效的質(zhì)量控制下,最大限度保證實驗數(shù)據(jù)的準確性及可重復(fù)性。
3.臨床試驗方案
臨床試驗實施前,研究人員應(yīng)從流行病學、統(tǒng)計學、臨床醫(yī)學、檢驗醫(yī)學等多方面考慮,設(shè)計科學合理的方案。各臨床試驗機構(gòu)的方案設(shè)置應(yīng)基本一致,且保證在整個臨床試驗過程中遵循預(yù)定的方案實施,不可隨意改動。整個試驗過程應(yīng)在臨床試驗機構(gòu)的實驗室內(nèi)并由本實驗室的技術(shù)人員操作完成,申報單位的技術(shù)人員除進行必要的技術(shù)指導外,不得隨意干涉試驗進程,尤其是數(shù)據(jù)收集過程。
試驗方案中應(yīng)確定嚴格的病例納入/排除標準,任何已經(jīng)入選的病例再被排除出臨床試驗都應(yīng)記錄在案,并明確說明原因。在試驗操作過程中和判定試驗結(jié)果時應(yīng)采用盲法以保證試驗結(jié)果的客觀性。各臨床試驗機構(gòu)選用的對比試劑應(yīng)一致,以便進行合理的統(tǒng)計學分析,同時方案中應(yīng)明確寫明對于對比試驗研究中測定結(jié)果不符的樣本進行確認試驗的第三方試劑或方法。
4.臨床試驗對象選擇
4.1基因型方面的考慮
HBV病毒為DNA病毒,其基因具有顯著的多樣性,不同的地區(qū)和民族,HBV流行的基因型不同。境內(nèi)流行的HBV基因型主要為B型、C型,部分地區(qū)存在少數(shù)D 型,以及重組型基因B/C型,B/D型,C/D型等。而且,HBV基因型具有一定的地域差異,不同地區(qū)流行的HBV基因型也不盡相同。因此,在選擇HBV感染者病例時,首先應(yīng)根據(jù)HBV流行的情況,選擇能代表我國不同地區(qū)流行基因型的HBV感染者病例,以對試劑檢測我國流行的HBV病毒的能力進行客觀科學的評價,選擇的基因型應(yīng)包括上述三種主要的基因型。
4.2病例選擇及樣本類型
應(yīng)涵蓋注冊申報試劑所聲稱的所有基因型,應(yīng)選擇部分干擾樣本(交叉反應(yīng)樣本),比較干擾組和病例組結(jié)果,以便對申報產(chǎn)品的臨床性能做出科學的分析。臨床試驗所需樣本總例數(shù)不少于500例,其干擾組例數(shù)的選擇以不超過總臨床樣本數(shù)的10%為宜。對于B型及C型基因型臨床樣本,應(yīng)滿足每種基因型不少于200例臨床樣本;對于D型基因型及其他基因型臨床樣本,建議每種不少于30例陽性病例。每種基因型臨床樣本應(yīng)來源于乙型肝炎病毒核酸檢測陽性的患者。如注冊申報試劑中包含其他基因型,應(yīng)結(jié)合這部分基因型在我國的流行病學特點,臨床應(yīng)用情況等綜合因素,對其臨床有效性進行科學評估。
在樣本選擇時,應(yīng)注重患者來源的不同地域性,不同病情進展,不同藥物治療方案等。對于干擾組樣本的選擇,應(yīng)考慮到在檢測過程中容易產(chǎn)生干擾,可能造成假陽性/假陰性的情況,以從臨床角度考察其分析特異性。
5.統(tǒng)計學分析
對臨床試驗結(jié)果的統(tǒng)計應(yīng)選擇合適的統(tǒng)計方法,如檢測結(jié)果一致性分析、不同基因型陰性/陽性符合率等。對于本類產(chǎn)品對比試驗的等效性研究,常選擇交叉四格表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進行四格表χ2檢驗或kappa檢驗以驗證兩種試劑定性結(jié)果的一致性,統(tǒng)計分析應(yīng)可以證明兩種方法的檢測結(jié)果有無明顯統(tǒng)計學差異。在臨床試驗方案中應(yīng)明確統(tǒng)計檢驗假設(shè),即評價考核試劑與參比試劑是否等效的標準。
6.結(jié)果差異樣本的驗證
在數(shù)據(jù)收集過程中,對于兩種試劑的檢測結(jié)果有不一致的樣本,如有必要,應(yīng)采用臨床上公認較好的第三種同類試劑或參考方法對結(jié)果進行確認,同時結(jié)合患者的臨床病情對差異原因及可
能結(jié)果進行分析。
7.臨床試驗總結(jié)報告撰寫
根據(jù)《體外診斷試劑臨床試驗技術(shù)指導原則》(國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第16號)的要求,臨床試驗總結(jié)報告應(yīng)該對試驗的整體設(shè)計及各個關(guān)鍵點給予清晰、完整的闡述,應(yīng)該對整個臨床試驗實施過程、結(jié)果分析、結(jié)論等進行條理分明的描述,并應(yīng)包括必要的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和統(tǒng)計分析方法。建議在臨床總結(jié)報告中對以下內(nèi)容進行詳述:
7.1臨床試驗總體設(shè)計及方案描述
7.1.1臨床試驗的整體管理情況、臨床試驗機構(gòu)選擇、臨床試驗主要研究人員簡介等基本情況介紹;
7.1.2病例納入/排除標準、不同年齡段人群的預(yù)期選擇例數(shù)及標準;
7.1.3樣本類型,樣本的收集、處理及保存等;
7.1.4統(tǒng)計學方法、統(tǒng)計軟件、評價統(tǒng)計結(jié)果的標準。
7.2臨床試驗具體情況
7.2.1臨床試驗所用產(chǎn)品的名稱、批號、有效期及所用機型等信息,以及對比試驗產(chǎn)品的注冊情況;
7.2.2對各臨床試驗機構(gòu)的病例數(shù)、年齡分布情況進行綜合分析,建議以列表或圖示方式給出具體例數(shù)及百分比;
7.2.3質(zhì)量控制,試驗人員培訓、儀器日常維護、質(zhì)控品運行情況,對檢測精密度、質(zhì)控品測量值的抽查結(jié)果評估;
7.2.4具體試驗過程,樣本檢測、數(shù)據(jù)收集、樣本長期保存、結(jié)果不一致樣本的校驗等。
7.3統(tǒng)計學分析
7.3.1數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改;
7.3.2陽性符合率、陰性符合率、總體符合率;
7.3.3以交叉多格表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進行多格表χ2檢驗或kappa檢驗以驗證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。應(yīng)明確將每種基因型單獨進行統(tǒng)計。
7.4討論和結(jié)論
對總體結(jié)果進行總結(jié)性描述并簡要分析試驗結(jié)果,對本次臨床試驗有無特別說明,最后得出臨床試驗結(jié)論。
(八)產(chǎn)品技術(shù)要求
擬定產(chǎn)品技術(shù)要求應(yīng)符合《辦法》和《體外診斷試劑注冊申報資料要求及說明》的相關(guān)規(guī)定。申請人應(yīng)當在原材料質(zhì)量和生產(chǎn)工藝穩(wěn)定的前提下,根據(jù)申請人產(chǎn)品研制、前期臨床評價等結(jié)果,依據(jù)國家標準、行業(yè)標準及有關(guān)文獻,按照《醫(yī)療器械產(chǎn)品技術(shù)要求編寫指導原則》(國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第9號)的有關(guān)要求編寫。內(nèi)容主要包含產(chǎn)品性能指標和檢驗方法。第三類產(chǎn)品技術(shù)要求中還應(yīng)當以附錄形式明確主要原材料、生產(chǎn)工藝及半成品要求。
附錄中應(yīng)將待測靶基因的基因位點、引物/探針設(shè)計及來源、參考品設(shè)置、來源及驗證情況、各種酶的來源、特性及驗證等重點內(nèi)容予以明確。
乙型肝炎病毒基因分型檢測試劑的產(chǎn)品技術(shù)要求應(yīng)主要包括以下性能指標:物理性狀、陰/陽性參考品符合率、精密度、最低檢測限等。陽性參考品主要考察對試劑盒覆蓋范圍內(nèi)不同基因的檢測符合性,陰性參考品則重點對申報試劑的分析特異性進行驗證。
(九)注冊檢驗
根據(jù)《辦法》要求,首次申請注冊的第三類產(chǎn)品應(yīng)該在國家食品藥品監(jiān)督管理總局認可的、具有相應(yīng)承檢范圍的醫(yī)療器械檢驗機構(gòu)進行連續(xù)3個生產(chǎn)批次樣品的注冊檢驗。對于已經(jīng)有國家標準品的檢測項目,在注冊檢驗時應(yīng)采用相應(yīng)的國家標準品進行檢驗;對于目前尚無國家標準品的項目,生產(chǎn)企業(yè)應(yīng)建立自己的參考品體系并提供相應(yīng)的內(nèi)部參考品。
(十)產(chǎn)品說明書
說明書承載了產(chǎn)品預(yù)期用途、標本采集及處理、實驗方法、檢驗結(jié)果解釋以及注意事項等重要信息,是指導實驗室工作人員正確操作、臨床醫(yī)生針對檢驗結(jié)果給出合理醫(yī)學解釋的重要依據(jù),是體外診斷試劑注冊申報最重要的文件之一。產(chǎn)品說明書的格式應(yīng)符合《體外診斷試劑說明書編寫指導原則》(國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第17號)的要求。境外試劑的中文說明書除格式要求外,其內(nèi)容應(yīng)盡量保持與原文說明書的一致性,翻譯應(yīng)準確且符合中文表達習慣。產(chǎn)品說明書的所有內(nèi)容均應(yīng)與申請人提交的注冊申報資料中的相關(guān)研究結(jié)果保持一致,如某些內(nèi)容引用自參考文獻,則應(yīng)以規(guī)范格式對此內(nèi)容進行標注,并單獨列明文獻的相關(guān)信息。
結(jié)合《體外診斷試劑說明書編寫指導原則》的要求,明確乙型肝炎病毒(HBV)基因分型檢測試劑說明書的重點內(nèi)容,以指導注冊申報人員更合理地完成說明書編制。
1.【預(yù)期用途】
應(yīng)至少包括以下內(nèi)容:
1.1 試劑盒用于體外定性檢測已明確為乙型肝炎病毒核酸陽性患者的血清、血漿等樣本中乙型肝炎病毒基因型。輔助醫(yī)療專業(yè)人員了解病人的乙型肝炎病毒基因型感染情況以及確定適當?shù)闹委煼椒ā?/p>
1.2 乙型肝炎病毒基因分型試劑的基因型應(yīng)至少包括B型、C型、D型,如果申請人略去上述任意一種推薦的基因型,應(yīng)給出合理的解釋。
1.3 適用人群:確診的慢性乙型肝炎病毒感染者。
1.4 簡要介紹乙型肝炎病毒基因型的特征,包括不同基因型的特征、不同基因型常見亞型、不同基因型在地域及人群中的分布情況、不同基因型在臨床的應(yīng)用特點。
1.5 強調(diào)該試劑盒檢測結(jié)果僅供臨床參考,不應(yīng)作為治療藥物調(diào)整的唯一依據(jù),臨床醫(yī)生應(yīng)結(jié)合患者病情及其他實驗室檢測指標等因素對患者治療進行綜合判斷。
2.【檢驗原理】
2.1 對試劑盒檢測能夠覆蓋的所有被檢測的基因型進行詳細描述(靶序列長度及來源區(qū)段、基因型類型及相關(guān)特征等),對引物及探針設(shè)計簡介、不同樣品反應(yīng)管組合、對照品設(shè)置及熒光信號檢測原理等進行逐項介紹。
2.2 核酸提取純化的方法、原理等。
2.3 試劑盒技術(shù)原理的詳細介紹,建議結(jié)合適當圖示進行說明。如反應(yīng)體系中添加了相關(guān)的防污染組分(如UNG酶),也應(yīng)對其作用機理作適當介紹。
3.【主要組成成分】
3.1 詳細說明試劑盒內(nèi)各組分的名稱、數(shù)量、比例或濃度、穩(wěn)定性等信息,陰性/陽性對照品(或質(zhì)控品)可能含有生物源性物質(zhì)的組分,應(yīng)說明其生物學來源、活性及其他特性;說明不同批號試劑盒中各組分是否可以互換。
3.2 試劑盒中如不包含該項檢測必需的組分,說明書中應(yīng)列出相關(guān)試劑/耗材的名稱、注冊證號(如有)及其他相關(guān)信息。
3.3 如果試劑盒中不包含用于核酸分離/純化的試劑組分,則應(yīng)在此注明經(jīng)驗證后推薦配合使用的商品化核酸分離/純化試劑盒的生產(chǎn)企業(yè)、產(chǎn)品名稱、注冊證號(如有)以及配套儀器等詳細信息。
4.【適用機型】
注明所有適用的儀器型號,并提供與儀器有關(guān)的重要信息以指導用戶操作。
5.【儲存條件及有效期】
說明試劑盒的效期穩(wěn)定性、開封穩(wěn)定性、復(fù)溶穩(wěn)定性、運輸穩(wěn)定性、凍融次數(shù)要求等,應(yīng)標明具體的儲存條件及效期。
6.【樣本要求】
6.1 樣本收集要求:如采集時間、采集順序等,是否受臨床癥狀、用藥情況等因素的影響。結(jié)合臨床需要并參照慢性乙型肝炎防治指南(現(xiàn)行版)相關(guān)要求。
6.2 血液樣本應(yīng)當說明對采血管及抗凝劑的要求:明確樣本類型、采血管和抗凝劑,其他樣本應(yīng)說明樣本采集、處理及保存方式。
6.3 樣本處理、運送及保存:對血液樣本離心條件的要求,核酸提取前的預(yù)處理、運送條件、保存條件及期限(短期、長期)等。冷藏/冷凍樣本檢測前是否需恢復(fù)至室溫,凍融次數(shù)的要求。如有需要應(yīng)對高于檢測范圍的樣本稀釋方法進行規(guī)定。
7.【檢驗方法】
詳細說明試驗操作的各個步驟:
7.1 試劑準備及配制方法、注意事項。
7.2 詳述待測樣本、質(zhì)控品核酸提取的條件、步驟及注意事項。
7.3 核酸提取/純化方法的詳細介紹。
7.4 擴增反應(yīng)前準備:加樣體積、順序等。
7.5 PCR各階段的溫度、時間設(shè)置、循環(huán)設(shè)置及相關(guān)注意事項。
7.6 儀器設(shè)置:特殊參數(shù)、結(jié)合探針的熒光素標記情況對待測基因及內(nèi)標的熒光通道選擇。
7.7 基線、循環(huán)閾值(Ct值)的選擇方法。
8.【陽性判斷值或者參考區(qū)間】
該類產(chǎn)品用于定性檢測,Cut-off值是檢測試劑有效區(qū)分檢測結(jié)果陽性和陰性的標準,如產(chǎn)品檢測原理為熒光PCR法。Cut-off的描述包括基線的確定方法和循環(huán)閾值(Ct值)的要求。除Ct值要求外,對于接近Cut-off值的弱陽性結(jié)果或者接近Cut-off值的陰性結(jié)果建議結(jié)合擴增結(jié)果的S形曲線對結(jié)果進行判斷。
9.【檢驗結(jié)果的解釋】
結(jié)合陽性對照、陰性對照以及反應(yīng)管中靶基因和內(nèi)標的檢測結(jié)果(Ct值),對所有可能出現(xiàn)的結(jié)果組合及相應(yīng)的解釋進行詳述。如存在檢測灰區(qū),應(yīng)對灰區(qū)結(jié)果的處理方式一并詳述。建議將不同結(jié)果的典型性圖譜納入說明書中,便于用戶對結(jié)果的讀取。
10.【檢驗方法的局限性】
10.1 該產(chǎn)品僅用于乙型肝炎病毒核酸檢測陽性患者的臨床樣本檢測。
10.2 該產(chǎn)品僅用于不同基因型的定性檢測,不適用定量檢測。
10.3該產(chǎn)品未包含全部乙型基因型別。該產(chǎn)品僅用于產(chǎn)品說明書預(yù)期用途所包含的已知基因型的檢測,不適用其他基因型及未知基因型的檢測。因此,當本試劑盒檢測結(jié)果為陰性時,并不能排除被檢測者帶有乙型肝炎病毒的其他基因位點。
10.4 如申報產(chǎn)品因產(chǎn)品原理導致無法對乙型肝炎病毒不同基因型混合樣本和重組型樣本進行區(qū)別,應(yīng)在產(chǎn)品說明書中進行注釋,幫助醫(yī)療專業(yè)人員對檢測結(jié)果進行客觀認識。
10.5 模板DNA 質(zhì)量將影響該產(chǎn)品檢測結(jié)果。模板DNA 的質(zhì)量可能受樣本來源、采集過程、運輸條件、樣本處理等因素影響,同時也受DNA提取方法、PCR 儀類型、操作環(huán)境以及當前分子生物學技術(shù)的局限性等的限制,可能導致出現(xiàn)假陽性和假陰性的檢測結(jié)果。使用者須了解檢測過程中可能存在的潛在風險。
10.6 該產(chǎn)品以乙型肝炎病毒基因上的特定DNA 片段為檢測靶標,如試劑盒引物與探針結(jié)合區(qū)出現(xiàn)基因突變,導致檢測結(jié)果異常,將影響檢測結(jié)果解釋。
11.【產(chǎn)品性能指標】
詳述以下性能指標:
11.1最低檢出限:說明試劑不同樣本類型及不同基因型的最低檢出限,簡要介紹最低檢出限的確定方法以及對最低檢出限驗證所采用的基因型。如不同基因型之間最低檢出限不同,應(yīng)分別列出。
11.2 精密度/重復(fù)性:精密度參考品的組分、濃度及評價標準、評價結(jié)果。
11.3 特異性:
11.3.1交叉反應(yīng):
易產(chǎn)生交叉反應(yīng)的其他病原體以及乙型肝炎病毒其他基因型的驗證情況,建議以列表的方式表示經(jīng)過交叉反應(yīng)驗證的病原體名稱、型別、濃度等信息。
11.3.2干擾物質(zhì):樣本中常見干擾物質(zhì)對檢測結(jié)果的影響。
11.3.3藥物影響:常用抗病毒藥物、干擾素等對檢測結(jié)果的影響,如未進行相關(guān)研究也應(yīng)提供相關(guān)警示說明。
11.3.4對比試驗研究(如有):簡要介紹對比試劑(方法)的信息、所采用的統(tǒng)計學方法及統(tǒng)計分析結(jié)果。
12.【注意事項】
應(yīng)至少包括以下內(nèi)容:
12.1 如該產(chǎn)品含有人源或動物源性物質(zhì),應(yīng)給出具有潛在
感染性的警告。
12.2 臨床實驗室應(yīng)嚴格按照《醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴增檢驗實驗室管理辦法》等有關(guān)分子生物學實驗室、臨床基因擴增實驗室的管理規(guī)范執(zhí)行。
三、名詞解釋
基因型:是指根據(jù)不同個體基因序列之間的規(guī)律性差異而分成的不同類型,用來描述基因本身的特征?;蛐头治隹设b定個體或病毒毒株之間的差異。
四、起草單位
國家食品藥品監(jiān)督管理總局醫(yī)療器械技術(shù)審評中心。
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